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This study was supported by the projects and funds PID2019-104439RB-C21/AEI/10.13039/501100011033 from the Agencia Estatal de Investigacion (AEI, Spain), co-funded by the European Regional Development Fund of the European Union: a Way to Make Europe (ERDF); ED431C 2021/11 and ED431B 2020/13 from the Conselleria de Cultura, Educacion e Ordenacion Universitaria (Xunta de Galicia) and ERDF. GRUPIN IDI/2022/000033 by the Regional Ministry of Science of Asturias (IDI/2022/000033). Co-funded by Independent Research Found Denmark (grant number 4184-00050) to the project Combining non-essential metabolic targets into suitable targets for control of uropathogenic Escherichia coli.

Análisis de autorías institucional

García Abad, IsidroAutor o Coautor

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29 de junio de 2023
Publicaciones
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Artículo

Genomics, biofilm formation and infection of bladder epithelial cells in potentially uropathogenic Escherichia coli (UPEC) from animal sources and human urinary tract infections (UTIs) further support food-borne transmission

Publicado en:One Health. 16 100558-100558 - 2023-05-20 16(), DOI: 10.1016/j.onehlt.2023.100558

Autores: Garcia, Vanesa; Leston, Luz; Parga, Ana; Garcia-Menino, Isidro; Fernandez, Javier; Otero, Ana; Olsen, John E; Herrero-Fresno, Ana; Mora, Azucena

Afiliaciones

CIBER de Enfermedades Respiratorias (CibeRes), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. - Autor o Coautor
Departamento de Microbioloxía e Parasitoloxía, Facultade de Bioloxía, Edificio CIBUS, Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela 15782, Spain. - Autor o Coautor
Department for Biological Safety, German Federal Institute for Risk Assessment, Berlin 10589, Germany. - Autor o Coautor
Department of Veterinary and Animal Sciences, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Frederiksberg 1870, Denmark. - Autor o Coautor
German Fed Inst Risk Assessment, Dept Biol Safety, D-10589 Berlin, Germany - Autor o Coautor
Grupo de Microbiología Traslacional, Instituto de Investigación Sanitaria del Principado de Asturias (ISPA), Oviedo 33011, Spain. - Autor o Coautor
Hosp Univ Cent Asturias HUCA, Serv Microbiol, Oviedo 33011, Spain - Autor o Coautor
Inst Invest Sanitaria Principado Asturias ISPA, Grp Microbiol Traslac, Oviedo 33011, Spain - Autor o Coautor
Inst Invest Sanitaria Santiago de Compostela IDIS, Santiago 15706, Spain - Autor o Coautor
Inst Salud Carlos III, CIBER Enfermedades Resp CIBERES, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago de Compostela (IDIS), Santiago 15706, Spain. - Autor o Coautor
Laboratorio de Referencia de Escherichia coli (LREC), Dpto. de Microbioloxía e Parasitoloxía, Universidade de Santiago de Compostela (USC), Lugo 27002, Spain. - Autor o Coautor
Pragmatech AI Solut, Artificial Intelligence & Stat Dept, Res & Innovat, Oviedo 33011, Spain - Autor o Coautor
Research & Innovation, Artificial Intelligence and Statistical Department, Pragmatech AI Solutions, Oviedo 33011, Spain. - Autor o Coautor
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Central de Asturias (HUCA), Oviedo 33011, Spain. - Autor o Coautor
Tech Univ Denmark, Natl Food Inst, DK-2800 Lyngby, Denmark - Autor o Coautor
Univ Copenhagen, Fac Hlth & Med Sci, Dept Vet & Anim Sci, DK-1870 Frederiksberg, Denmark - Autor o Coautor
Univ Santiago de Compostela USC, Dept Microbiol & Parasitol, Lab Referencia Escherichia Coli LREC, Lugo 27002, Spain - Autor o Coautor
Univ Santiago de Compostela, Fac Biol, Dept Microbiol & Parasitol, Edificio CIBUS, Santiago De Compostela 15782, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Escherichia coli is the main cause of urinary tract infections (UTI). While genomic comparison of specific clones recovered from animals, and human extraintestinal infections show high identity, studies demonstrating the uropathogenicity are lacking. In this study, comparative genomics combined with bladder-cell and biofilm formation assays, were performed for 31 E. coli of different origins: 7 from meat (poultry, beef, and pork); 2 from avian-farm environment; 12 from human uncomplicated UTI, uUTI; and 10 from human complicated UTI, cUTI. These isolates were selected based on their genetic uropathogenic (UPEC) status and phylogenetic background. In silico analysis revealed similar virulence-gene profiles, with flagella, type 1 and curli fimbriae, outer-membrane proteins (agn43, ompT, iha), and iron-uptake (iutA, entA, and fyuA) associated-traits as the most prevalent (>65%). In bladder-cell assays, moderate to strong values of association (83%, 60%, 77.8%) and invasion (0%, 70%, 55.5%) were exhibited by uUTI, cUTI, and animal-derived isolates, respectively. Of interest, uUTI isolates exhibited a significantly lower invasive capacity than cUTI isolates (p < 0.05). All isolates but one produced measurable biofilm. Notably, 1 turkey meat isolate O11:H6-F-ST457, and 2 cUTI isolates of the pandemic lineages O83:H42-F-ST1485-CC648 and O25b:H4-B2-ST131, showed strong association, invasion and biofilm formation. These isolates showed common carriage of type 1 fimbriae and csg operons, toxins (hlyF, tsh), iron uptake systems (iutA, entA, iroN), colicins, protectins (cvaC, iss, kpsM, traT), ompT, and malX. In summary, the similar in vitro behaviour found here for certain E. coli clones of animal origin would further reinforce the role of food-producing animals as a potential source of UPEC. Bladder-cell infection assays, combined with genomics, might be an alternative to in vivo virulence models to assess uropathogenicity.© 2023 The Author(s).

Palabras clave

biofilmcell infectioncoliepidemiologyfood-bornest1193upecutivirulenceAutotransporter proteinBiofilmCell infectionEE. coliFood-borneSt1193UpecUti

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista One Health debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 54/408, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Public, Environmental & Occupational Health.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 7.61, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions Jul 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-07-05, el siguiente número de citas:

  • WoS: 8
  • Europe PMC: 4

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-05:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 53.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 83 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 22.8.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 13 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 2 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Denmark; Germany.